Le résultat de près de 400 ans d'élevage sélectif, les historiens ont tendance à soutenir la race de cheval miniature comme un dérivé de nombreuses sources. À l'époque préhistorique, les petites races de chevaux étaient très probablement le produit de climats naturels rigoureux et d'une alimentation limitée. Aujourd'hui, la connaissance de la génétique a fait de la possibilité de se reproduire spécifiquement pour la taille une réalité.

La première mention d'un petit cheval importé aux États-Unis remonte à 1888; et la recherche montre peu de sensibilisation du public aux vraies miniatures jusqu'en 1960. La croyance populaire est que les chevaux miniatures américains ont utilisé le sang des chevaux de mines anglais et néerlandais introduits dans ce pays au 19ème siècle et utilisés dans certaines mines de charbon des Appalaches jusqu'en 1950. L'Américain Le cheval miniature, tel que documenté dans les pedigrees de Miniatures aujourd'hui, a également puisé dans le sang du poney Shetland. Tout au long de son passé coloré, la race de cheval miniature avait été élevée pour les animaux de compagnie, la nouveauté, la recherche, le gain monétaire, le travail minier, l'exposition et les cadeaux royaux.